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Post-doc ou ingénieur, 6 mois en annotation sémantique de textes
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L'équipe Bibliome de l'unité MIG (INRA) recherche un post-doctorant
(niveau thèse) ou ingénieur (niveau Master) à temps plein pour une durée
de 5 à 6 mois sur l'annotation manuelle et automatique d'articles
scientifiques de biologie guidée par un modèle de connaissance dans le
cadre du projet DataChallenge conjoint MIG et LIMSI (CNRS). Il est
financé par le Center for Data Science (Idex Paris-Saclay).

La personne engagée coordonnera la finalisation de l'annotation manuelle
d'articles de biologie moléculaire par des experts biologistes en vue de
la préparation d'une tâche pour un challenge d'extraction automatique
d'information à partir de textes. Le domaine concerné est le
développement de la graine chez l'arabette (Arabidopsis thaliana). Le
modèle de connaissances qui est utilisé pour l'annotation devra être
comparé à d'autres modèles proposés pour d'autres espèces (humain,
procaryotes). Un modèle de représentation des connaissances unifié
pourra être proposé pour la représentation des connaissances du texte
qui soit approprié à son utilisation en Biologie des Systèmes.

Compétences: extraction d'information, annotation manuelle de texte, 
ingénierie de la connaissance, biologie moléculaire.

Candidature : envoi du CV et de publications par email.
Contact : Claire Nédellec (claire.nedellec@jouy.inra.fr) et Robert Bossy
(robert.bossy@jouy.inra.fr)

Lieu de travail : Unité MIG, centre de recherche INRA de Jouy-en-Josas.
Date de début de contrat : dès que possible
Rémunération : grille de salaire INRA
Références:
   Bibliome : http://genome.jouy.inra.fr/bibliome/
   CDS : 
http://www.campus-paris-saclay.fr/index.php/en/Idex-Paris-Saclay/Les-Lidex/Paris-Saclay-Center-for-Data-Science 

   BioNLP-ST 2013 (tasks GE & GRN): 
https://sites.google.com/site/bionlpst2013/
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