DEVELOPPEMENT D'UN SERVICE WEB POUR LE FILTRAGE DE LA LITTERATURE
SCIENTIFIQUE

Natalia Grabar (natalia.grabar@spim.jussieu.fr), 
Dr Isabelle Colombet (isabelle.colombet@spim.jussieu.fr)

Centre de Recherche des Cordeliers; U Paris Descartes, UMR_S 872;
INSERM, U872 eq 20; HEGP AP-HP

CONTEXTE. Le contexte s'inscrit dans le paradigme de la médecine
fondée sur les preuves (EBM), qui consiste à fonder les décisions
médicales sur des preuves scientifiques authentifiées. Le niveau de
preuve est établi grâce à des revues systématiques de la littérature
biomédicale. Ces revues sont extrêmement lourdes à réaliser du fait du
volume important de la littérature à analyser et filtrer. L’aide
automatique à la réalisation de ces revues systématiques représente un
enjeu important pour la synthèse de connaissances médicales.
Une étape clé de la réalisation des revues systématiques est
l’extraction et l'examen sélectif des citations bibliographiques pour
sélectionner les articles pertinents. En effet, une sélection non
exhaustive des études existantes sur une question de recherche donnée
aboutirait à des résultats biaisés. Les méthodes d'analyse textuelle
et sémantique aident le processus de sélection des articles.


OBJECTIFS. Développer un service Web pour aider la réalisation de
l'examen sélectif d’articles :

- proposer une connexion avec des bases bibliographiques (Medline,
Embase, ...)  pour la récupération des références bibliographiques et
le téléchargement des articles

- fusionner les références bibliographiques provenant de différentes
  bases

- alimenter une base de données avec les articles scientifiques à
  analyser

- intégrer les méthodes d'analyse textuelle et sémantique dans le
  processus de tri et de filtrage des résumés

- développer une interface Web pour la sélection et gestion des
  articles, en accord avec les utilisateurs référents


Requis : technologies Web (Java, Javascript, PHP, ...), Perl.
Une sensibilité au traitement automatique de langue et à la recherche
d'information sont un plus.


Date limite pour l'envoi des candidatures: 31 octobre 2009

CDD d'un an, éventuellement prolongeable.
Rémunération selon l'expérience.

Le CV et une lettre de motivation sont à envoyer à Natalia Grabar
(natalia.grabar@spim.jussieu.fr) et Isabelle Colombet
(isabelle.colombet@spim.jussieu.fr).