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Offre d'ingénieur d'études de 12 mois au Lifat, université de Tours :
annotation automatique d'expériences en biologie systémique
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****Description**** 

Dans le cadre du projet ANR Abliss (Automating Building from Literature
of Signalling Systems), le laboratoire de recherche en informatique
fondamentale et appliquée (Lifat) de l'université de Tours recrute, à
compter de mars-avril 2019, un ingénieur d'études sur 12 mois (avec
prolongement possible sur 6 à 12 mois) ou un doctorant pour une thèse à
cheval sur la fouille de texte et la biologie.

La personne recrutée travaillera sur le logiciel libre Unitex pour
modéliser (dans des textes en anglais) les protéines, gènes, molécules,
etc. qui apparaissent dans des descriptions d'expériences extraites des
articles scientifiques du domaine de la biologie systémique. Ceci pour
sélectionner les phrases contenant de telles descriptions et les annoter
sous une forme Prédicat-Arguments. Il aura aussi pour charge le
dépouillement et l'analyse des résultats obtenus.


****Compétences**** 

Idéalement, la personne candidate devra être titulaire d'un master en
bio-informatique (si possible avec une licence en informatique ou un
master mention CCI). Des candidatures avec un master en traitement
automatique des langues (avec une formation informatique) sont aussi
possibles, sous réserve de connaissances en biologie. La connaissance
d'Unitex peut être un plus, mais n'est pas obligatoire.

****Localisation**** 

Le poste est situé au laboratoire de recherche en informatique
fondamentale et appliquée (Lifat) de l'université de Tours, 64 avenue
Jean-Portalis, 37200 Tours. La personne recrutée travaillera dans
l'équipe BdTln. Des déplacements chez les autres partenaires du projet
(INRA de Tours et LRI de l'université Paris-Sud) pourront être
demandés.

****Rémunération**** 

La rémunération, selon expérience, suit la grille des ingénieurs
d'études de l'enseignement supérieur, qui débute à 1713,20¤ brut.

****Date limite de candidature**** 

28 février 2019 

****Procédure de candidature**** 

Merci de joindre une lettre de motivation et un CV avec un contact
académique et, éventuellement, une lettre de recommandation.

Contacts : Denis Maurel (Lifat) et Anne Poupon (INRA) 
denis.maurel@univ-tours.fr, anne.poupon@inra.fr