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Stage de master de 6 mois au Lifat, université de Tours : annotation
automatique d'expériences en biologie systémique
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****Description**** 

Dans le cadre du projet ANR Abliss (Automating Building from Literature
of Signalling Systems), le laboratoire de recherche en informatique
fondamentale et appliquée (Lifat) de l'université de Tours propose un
stage de master de 6 mois (avec prolongement possible par un CDD ou une
thèse), à compter de mars-avril 2019.
Le stagiaire travaillera sur le logiciel libre Unitex pour modéliser
(dans des textes en anglais) les protéines, gènes, molécules, etc. qui
apparaissent dans des descriptions d'expériences extraites des articles
scientifiques du domaine de la biologie systémique. Ceci pour
sélectionner les phrases contenant de telles descriptions et les annoter
sous une forme Prédicat-Arguments. Il aura aussi pour charge le
dépouillement et l'analyse des résultats obtenus.

****Compétences**** 

Idéalement, la personne candidate devra être dans un master en
bio-informatique (si possible avec une licence en informatique) ou un
master mention CCI (avec des études antérieures en biologie). Des
candidatures d'étudiants en master de traitement automatique des langues
(avec une formation informatique) sont aussi possibles, sous réserve de
connaissances en biologie. La connaissance d'Unitex peut être un plus,
mais n'est pas obligatoire.

****Localisation**** 

Le stage est situé au laboratoire de recherche en informatique
fondamentale et appliquée (Lifat) de l'université de Tours, 64 avenue
Jean-Portalis, 37200 Tours. La personne recrutée travaillera dans
l'équipe BdTln. Des déplacements chez les autres partenaires du projet
(INRA de Tours et LRI de l'université Paris-Sud) pourront être demandés.

****Gratification**** 

La gratification est celle prévue par la loi. 

****Date limite de candidature**** 

28 février 2019 

****Procédure de candidature**** 

Merci de joindre une lettre de motivation et un CV avec un contact
académique et, éventuellement, une lettre de recommandation.

Contacts : Denis Maurel (Lifat) et Anne Poupon (INRA) 
denis.maurel@univ-tours.fr, anne.poupon@inra.fr